党群系统

• 办公室（宣传部）
• 纪委办公室
• 工会委员会
• 组织部（统战部）
• 学生工作部（人民武装部）
• 共青团委员会

行政系统

• 办公室（国际交流与合作处）
• 教务处（升本办公室）
• 校园安全管理处
• 监察审计室（与纪委办合署）
• 科研处（科技产业与社会服务处）
• 实验室与资产管理处
• 学生处（与学生工作部合署）
• 招生就业处（校友工作办公室）
• 总务处（奉化校区建设办公室）
• 人事处（教师发展中心）
• 计划财务处

学校教学机构

• 药学院
• 中药学院
• 基础学院
• 制药工程学院
• 食品学院
• 继续教育学院
• 商学院
• 医疗器械学院
• 马克思主义学院

教辅机构

• 教学质量管理中心（产教融合与应用型大学建设研究所）
• 图书与信息中心（图书馆、信息中心)